Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms