Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SnrkQ8VDU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrkQ8VDU5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrkQ8VDU5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms