Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms