Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt25Q8VCW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt25Q8VCW2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms