Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BbxQ8VBW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BbxQ8VBW5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BbxQ8VBW5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BbxQ8VBW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BbxQ8VBW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms