Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc9a8Q8R4D1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a8Q8R4D1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms