Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmpQ8R373 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmpQ8R373 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmpQ8R373 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmpQ8R373 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmpQ8R373 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmpQ8R373 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClmpQ8R373 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClmpQ8R373 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClmpQ8R373 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms