Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim29Q8R2Q0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim29Q8R2Q0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms