Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg10Q8R1P4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms