Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rdh16f2Q8K3M1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rdh16f2Q8K3M1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Rdh16f2Q8K3M1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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