Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OptnQ8K3K8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms