Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs8Q8K3J1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms