Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd2Q8K2Z4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd2Q8K2Z4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms