Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6bQ8K2H2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6bQ8K2H2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms