Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtmr3Q8K296 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtmr3Q8K296 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtmr3Q8K296 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms