Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcho1Q8K285 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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