Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim68Q8K243 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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