Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh3Q8K1E6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms