Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms