Protein–RNA interactions for Protein: Q8K025

Frat2, GSK-3-binding protein FRAT2, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat2Q8K025 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat2Q8K025 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat2Q8K025 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat2Q8K025 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms