Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ago3Q8CJF9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ago3Q8CJF9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms