Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klre1Q8CJC7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klre1Q8CJC7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms