Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Znf628Q8CJ78 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Znf628Q8CJ78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Znf628Q8CJ78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Znf628Q8CJ78 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf628Q8CJ78 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.3 ms