Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbsnQ8CIT9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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