Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnka2ipQ8CH19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnka2ipQ8CH19 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnka2ipQ8CH19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnka2ipQ8CH19 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnka2ipQ8CH19 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnka2ipQ8CH19 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnka2ipQ8CH19 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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