Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc43a2Q8CGA3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms