Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx8Q8CFD4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms