Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl11Q8CE33 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl11Q8CE33 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl11Q8CE33 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms