Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU5

Efhb, EF-hand domain-containing family member B, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EfhbQ8CDU5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EfhbQ8CDU5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EfhbQ8CDU5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms