Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdac7Q8C2B3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hdac7Q8C2B3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms