Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim47Q8C0E3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim47Q8C0E3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim47Q8C0E3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim47Q8C0E3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim47Q8C0E3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim47Q8C0E3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim47Q8C0E3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms