Protein–RNA interactions for Protein: Q8C078

Camkk2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk2Q8C078 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camkk2Q8C078 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Camkk2Q8C078 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Camkk2Q8C078 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms