Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfrp1Q8BXL7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms