Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp5Q8BX09 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms