Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp38Q8BW70 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms