Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr9Q8BV84 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr9Q8BV84 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms