Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnrc6bQ8BKI2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms