Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo28Q8BIG4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms