Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timm29Q8BGX2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms