Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ2

Csrnp2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp2Q8BGQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp2Q8BGQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp2Q8BGQ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp2Q8BGQ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp2Q8BGQ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp2Q8BGQ2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp2Q8BGQ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrnp2Q8BGQ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csrnp2Q8BGQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp2Q8BGQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms