Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg4bQ8BGE6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4bQ8BGE6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4bQ8BGE6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4bQ8BGE6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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