Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sv2bQ8BG39 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sv2bQ8BG39 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms