Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdspl2Q8BG15 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdspl2Q8BG15 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms