Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfascQ810U3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms