Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cracr2bQ80ZJ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cracr2bQ80ZJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms