Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sestd1Q80UK0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms