Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp3Q7TST5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms