Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClmQ7TSN2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClmQ7TSN2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms