Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IfnkQ7TSL0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IfnkQ7TSL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms