Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ckap2lQ7TS74 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms